Um homem caído no deserto e sem memórias é acolhido por Koji Kabuto e nomeado Daisuke. Embora os dias pareçam pacíficos, um fenômeno não identificado aparece nos céus das principais cidades do mundo. Era Vega, uma força militar de um sistema estelar distante da Terra. Vega invade a Terra com seu poderio militar superior. Mazinger Z, a última esperança do planeta, trava uma batalha ardua contra bestas em forma de disco até que, no meio desta situação desesperadora, um herói lendário surge. A bordo de um robô gigante está Daisuke, que revala-se Duke Fleed, o príncipe que foi forçado a fugir de sua casa, o planeta Fleed…