A história gira em torno de Matsukaze Tenma que luta para recuperar o amor e a liberdade do futebol. Depois do triunfo do Inazuma Japão, o futebol amador agora é manipulado pelo 5º setor, mas, Matsukaze Tenma agora luta para livrar a Raimon do 5º setor e conseguir reconhecimento. Conseguiu fazer outros amigos, Shindou Takuto, Sangoku Taichi, Tsurugi Kyosuke e outro de seus melhores amigos, Shinsuke Nishizono. Com a saída de Kudou, Endo retoma o posto de técnico e agora ajuda o time a sair das mãos do 5º setor. Mais adiante, outros membros antigos que era do time de Endo ajude a Raimon sair das mãos do 5º setor.